بررسی تنوع ژنتیکی آفتابگردان توسط مارکر مولکولی ssr

thesis
  • وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی
  • author سید مجید عزیزی
  • adviser غلام رضا بخش خانیکی
  • Number of pages: First 15 pages
  • publication year 1389
abstract

38 آغازگر بکار رفته در این مطالعه منجر به ایجاد 89 آلل مختلف با متوسط 3.17 گردید. بیشترین تعداد آلل? در مکان ژنیors 1068 دیده شد که در حدود 4 آلل بود. دلیل کشف کم تعداد آلل در مطالعه حاضر می تواند به دلیل استفاده از ژل آگارز باشد. ژل آگاروز قدرت تفکیک کمتری نسبت به ژل پلی آکریل آمید دارد. میزان رنج pic در ژنوتیپ های مورد مطالعه، بین 0.09 برای پرایمر ha3555 تا 0.62 برای پرایمر ors598 با میانگین 0.41 بود. پرایمرهای با pic بالا مثلors160, ors16, ors920, ors1068, ha4149, ha2879, ors988, ors899, ors1088, ors598, ors822 را می توان به طور موثر در مطالعات تنوع ژنتیکی آفتابگردان استفاده نمود. تعداد آلل موثر(ne) نیز از 1.09 در مکان ژنی ha3555 تا 2.73 در ors488 متغیر بود (جدول 1). متوسط ne، 1.76 برآورد شد (جدول 1). بیشترین میزان هتروزیگوسیتی مشاهده شده (obsh) درحدود 0.81 در مکان ژنی ors488 و کمترین میزان آن در مکان ژنی ors 613 درحدود 0 مشاهده گردید (جدول 1). بیشترین هتروزیگوسیتی مورد انتظار (exph) در حدود 0.64 و کمترین میزان آن در حدود 0.08 به ترتیب به مکان های ژنی ors488 وha3555 تعلق داشتند(جدول 1). میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار و مشاهده شده به ترتیب 0.45 و 0.16 مشاهده شد(جدول 1). با توجه به آزمون کای اسکور در هر مکان ژنی نتیجه گیری گردید که جمعیت مورد مطالعه در تعادل هاردی واینبرگ نیست (جدول 1). جهت روشن شدن روابط ژنتیکی بین ارقام تجزیه خوشه ای به روش upgma بر اساس روش جاکارد صورت گرفت (شکل 1). ضریب شباهت ژنتیکی جاکارد ((gsj در میان ژنوتیپ ها حداکثر 0.9 ( بین ژنوتیپ rt931 , ensat-r5) و حداقل 0.25 ( بین ژنوتیپ lc1064c , lr64 ) با میانگین شباهت ژنتیکی 0.48 بود. که این میزان (0.48) سطح بالایی از تنوع ژنتیکی را در میان ژنوتیپ های مورد مطالعه را نشان می دهد. 28 ژنوتیپ مورد مطالعه بر اساس الگوریتم upgma در چهار گروه، کلاستر بندی شدند. همچنین نتایج pcoa بدست آمده تا حد زیادی مشابه نتایج آنالیز کلاستر بود. در گروه دوم بیشترین شباهت (0.66 gsj=) بین ژنوتیپ c81 , c79 وجود دارد، که هر دو ژنوتیپ ril با منشاء جغرافیایی یکسان هستند. این گروه به سه زیر گروه تقسیم می شود که زیر گروه دوم خود متشکل از lr64, c79, c81, c43, rha266 می باشد. ژنوتیپrha266 خود یکی از والدین ژنوتیپ های این زیر گروه می باشد. در گروه سوم بیشترین میزان شباهت (0.52 gsj=) بین ژنوتیپ as613 , m6-133-2 وجود دارد. ژنوتیپ های m6-133-2 ، m6-85-3 , m6-894-2 لاین های حاصل از جهش، توسط اشعه گاما روی ژنوتیپ as613 می باشند که همگی در گروه سوم قرار گرفتند. در گروه چهارم بیشترین میزان شباهت (0.57 gsj=) بین ژنوتیپ h565r ، as5305 ( لاین های اصلاحی با منشاء جغرافیایی یکسان (فرانسه)) وجود دارد. در این گروه ژنوتیپ های sdr18, sdr19, sdb1 , sdb3 قرار دارند که مقاوم به بیماری phoma black stem می باشند (اطلاعات منتشر نشده) که این لاین ها از برنامه های اصلاحی آفتابگردان در دانشگاه داکوتای جنوبی بدست آمده اند.

First 15 pages

Signup for downloading 15 first pages

Already have an account?login

similar resources

بررسی تنوع ژنتیکی مارکر rs438601در جمعیت اصفهان: یک مارکر آگاهی‌دهنده در تشخیص‌های مولکولی هموفیلی B

Introduction: Hemophilia B is an X-linked recessive genetic disease caused by mutations in the coagulation Factor IX gene. Mutations in the Factor IX gene result in dysfunction or deficiency of coagulation factor of IX. Direct mutation analysis involves the ideal method for molecular diagnosis of the disease. However, due to the high number of identified mutations in the gen, the lack of a comm...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی نمونه های آلوی وحشی و تجاری با استفاده از مارکر ملکولی SSR

امروزه آلو یکی از درختان میوه مهم در بسیاری از کشورهای جهان می‌باشد. آگاهی از تنوع ژنتیکی ژرم‌پلاسم‌های موجود امکان انتخاب والدین در بهبود برنامه‌های اصلاحی را فراهم می‌کند. جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی و مشخص نمودن روابط ژنتیکی بین ژنوتیپ‌های آلوی ایران (رامسر، کرج و مشهد) و ژنوتیپ‌های تجاری موجود در مرکز تحقیقات گروه علوم باغبانی دانشگاه تهران و همچنین نمونه میروبالان از هشت نشانگر ریزماهواره استف...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های گونه Thymus eriocalyx با استفاده از مارکر مولکولی RAPD

جنس .Thymus L یکی از بزرگترین جنس های خانواده نعنا و گیاهان آروماتیک  است. گیاهان این جنس به دلیل دارا بودن اسانس­ های روغنی ارزش تجاری دارند. گونه Thymus eriocalyx  یکی از گونه های این جنس است که انحصاری فلات ایران است. به منظور بررسی های مولکولی در افراد جمعیت های گونه Thymus eriocalyx در ایران، 10 رویشگاه در استانهای لرستان، مرکزی، همدان، کرمانشاه و کردستا...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی SSR و ISJ

به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا از 20 جفت آغازگر اختصاصی SSR و نیمه‌تصادفی ISJ استفاده شد. آغازگرها در مجموع 158 (05/81 درصد) باند چند­شکل (51 باند SSR و 107 باند ISJ) تولید کردند. متوسط تعداد باند چندشکل برای آغازگرهای ISJ، SSR و ترکیب آنها به‌ترتیب 7/10، 1/5 و 9/7 عدد برآورد شد. میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) از 015/0 در آغازگر اختصاصی O110D08 تا 3420/0 در آغازگر نیمه‌اختصاصی ET15-33 متغی...

full text

بررسی تنوع ‌ژنتیکی انار‌شیطان (Tecomella undulata (Roxb.) Seem.) با استفاده از نشانگر مولکولی SSR

انار‌‌شیطان (Tecomella undulata (Roxb.) Seem.) ‌‌ویژگی‌‌هایی مهمی مانند مقاومت مناسب به دمای زیاد و خشکی، تثبیت شن‌‌های روان، خاصیت دارویی و نیز چوب محکم و بادوام ‌‌دارد. در این پژوهش، تنوع ژنتیکی 30 ژنوتیپ از این گونه در استان‌‌های بوشهر، کرمان و هرمزگان با استفاده از نشانگر SSR بررسی شد. پس از استخراج DNA، تکثیر با استفاده از چهار آغازگر ریزماهواره به‎روش PCR انجام شد. پس از الکتروفو...

full text

بررسی مولکولی تنوع ژنتیکی در لاین‌های دابل‌ هاپلوئید گندم نان با استفاده از نشانگرهای SSR

Wheat (Triticum aestivum L.) is a member of the Poaceae family, an annual and self-pollinated crop which has three groups of 14, 28 and 42 chromosomes with genome formula AA, AABB, AABBDD that the chromosomes are located in three homeologous genomes A, B and D. Wheat has an extremely large genome of 16 × 109 base pairs with more than 80% repetitive DNA and an average of 810 mega base pairs in ...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023